Для многих иммигрантов прибытие на остров Эллис-Айленд продлится от одной недели до нескольких месяцев. Если возникает проблема с пассажиром, связанная с легальными или медицинскими показаниями, то пассажир удаляется и помещается в один из корпусов больницы, расположенный рядом с входом на главный уровень. В зависимости от ситуации это лицо либо будет находиться на острове в течение недели или месяца, либо будет депортировано обратно в свою страну происхождения. Больница на острове является одной из крупнейших государственных больниц Соединенных Штатов. На двух островах имеется двадцать два больничных корпуса. С учетом статуса больницы и численности ее персонала, в котором работает более 300 врачей, медсестер и другого медицинского персонала, больница, как хорошо известно, привлекала медицинских наблюдателей из стран Европы Соединенных Штатов.